FileLinx biedt de volgende authenticatie mogelijkheden.
1. Basic authenticatie (gebruikersnaam en wachtwoord).
2. Two factor authenticatie bovenop punt 1.
3. Multi-factor authenticatie (MFA) voor Microsoft 365. De meest aangeraden manier m.b.t. beveiliging.
Hiermee is de organisatie die FileLinx gebruikt volledig in control over de authenticatie methodes.